【私の答え】

きっちりと納まらないことはよくあります。
梅を並べながら絶えず残量を見て(面倒ですが、最初に数を数え、容器の1列が何コぐらいなのか検討をつけておくといいかもしれません)、あと1列あるか、2列で終わるのか、ってそのあたりを考えながら調整します。で、小さい梅や大きい梅で隙間調整してください。
でも、どうせ梅は小さくなり凹みます。蓋が出来なくてもラップで覆っておけば問題ありません。下の写真は、2025年の10kgの梅です。最初は蓋が閉まらず、ラップで覆っています。20時間後には梅が沈んだので蓋をします。